С момента начала массового секвенирования геномов методы биоинформатики и системной компьютерной биологии прочно вошли в арсенал исследовательских инструментов, используемых во всех областях наук о жизни. Однако в последнее десятилетие их значимость еще более возросла: в связи со стремительным развитием омиксных технологий (геномики, транскриптомики, протеомики, метаболомики) и других высокопроизводительных методов экспериментального исследования молекулярно-генетических систем и процессов в генетике произошел информационный взрыв, и она стала главным источником больших данных, перегнав по темпам роста все другие науки и технологии. 

«Огромные объемы и сложность накапливаемых в настоящее время больших генетических данных требуют создания информационно-программных комплексов, основанных на новом поколении методов биоинформатики и системной компьютерной биологии, использующих вычислительные конвейеры, реализующие сложные сценарии анализа и интегрирующие большое количество разнообразных программных продуктов и баз данных, в том числе — с использованием методов искусственного интеллекта», — отметил научный руководитель ИЦиГ СО РАН академик Николай Александрович Колчанов.

Такой подход подразумевает развитие не только собственно биологических методов исследований, но и математического аппарата для работы с ними. Очередным шагом на этом пути стало соглашение о сотрудничестве, заключенное между ИЦиГ СО РАН и ИВМиМГ СО РАН.

Прежде всего, речь идет о совместной работе над созданием интегрированной цифровой платформы «Биоинформатика и системная компьютерная биология». «Главная наша задача — совместными усилиями создать программную платформу, объединяющую методы анализа геномной информации и математические методы ее обработки для проведения прорывных исследований в области живых систем», — рассказал директор ИВМиМГ СО РАН, профессор РАН доктор физико-математических наук Михаил Александрович Марченко.

Создаваемый программный комплекс будет ориентирован на поддержку фундаментальных и прикладных исследований в области наук о жизни, в том числе в таких важных направлениях, как биомедицина, фармакология, биотехнологии, сельское хозяйство, экология, биобезопасность.

Кроме того, соглашение подразумевает сотрудничество двух институтов при подготовке специалистов высшей квалификации в области биоинформатики, компьютерной системной биологии, анализа больших данных, анализа изображений, математического моделирования, высокопроизводительных вычислений, а также совместную организацию и координацию научного направления по биоинформатике и компьютерной системной биологии в журнале «Проблемы информатики», издаваемом ИВМиМГ СО РАН. 

По материалам пресс-службы ИЦиГ СО РАН

Больше информации о программе «Академгородок 2.0» и СКИФ — на нашем телеграм-канале

Программа разрабатывалась совместно сотрудниками Математического центра в Академгородке и ФИЦ ИЦиГ СО РАН. Обучаться на ней смогут студенты, закончившие бакалавриат факультета естественных наук, факультета информационных технологий или механико-математического факультета НГУ. Планируется набор около 30 человек.  

По словам директора Математического центра в Академгородке, заместителя директора Института математики им. С. Л. Соболева СО РАН доктора физико-математических наук Евгения Петровича Вдовина, геномные исследования — это одно из самых актуальных и перспективных направлений. Они могут дать огромный прорыв в самых разных областях: медицине, пищевой безопасности, экологии. 

«В этой программе будут курсы, связанные с генетикой, обработкой больших данных и различными математическими системами. Поскольку магистратура направлена на подготовку кадров, связанных с геномными исследованиями, обязательной частью станет именно научная работа. Уже готовится запуск совместных исследовательских групп, — рассказал Евгений Вдовин. — В магистратуре ребята станут сразу работать по реальным научным проектам. В перспективе мы считаем, что наши специалисты будут способны работать в любых областях, связанных с динамическими системами обработки больших данных, а этих областей очень много, в том числе в биологии, например моделирование живых систем».

«Наука в Сибири»