Коклюш — острое инфекционное заболевание, которое в основном поражает невакцинированных детей и подростков. Наиболее характерным признаком коклюша является является приступообразный лающий кашель. Коклюш и подобные ему инфекции вызывается несколькими видами бактерий Bordetella, включая B. pertussis, B. parapertussis, B. bronchiseptica и B. holmesii. Коклюш легко распространяется, при общении с больным заражаются около 90 % людей, не имеющих специфического иммунитета. В последние годы заболеваемость коклюшем выросла, поэтому необходимы простые и дешевые методы диагностики, позволяющие контролировать распространение инфекции.

Чаще всего для диагностики бордетелл используются тесты на основе иммуноферментного анализа (ИФА) и ПЦР. ИФА относительно дешев, однако чувствительность этого подхода ниже, чем у методов, выявляющих нуклеиновые кислоты. Коммерческие ПЦР-тесты отличаются высокой чувствительностью, но для их проведения необходимы специализированные диагностические лаборатории с дорогостоящим оборудованием и квалифицированным персоналом, что увеличивает стоимость и время анализа (несколько часов).

Сотрудники ИХБФМ СО РАН создали тесты на основе изотермической петлевой амплификации (от англ. Loop mediated isothermal amplification, LAMP — техника амплификации ДНК в одной пробирке) и количественной полимеразной цепной реакции (ПЦР), позволяющие быстро и точно выявлять четыре вида бордетелл, вызывающих инфекции у человека. Чувствительность LAMP несколько ниже, чем у ПЦР-теста, однако время проведения LAMP составляет всего 30 минут, не требует специальных приборов.

«Разработанные тесты были апробированы на клинических образцах, взятых у пациентов с респираторными инфекциями. Оба метода показали высокую чувствительность и специфичность, выявляя наличие в образце только ДНК бордетелл, а не других патогенов. Согласованность результатов между двумя LAMP и ПЦР составила 94,5 %, что подтверждает их надежность для использования в медицинской практике», — рассказывает младший научный сотрудник лаборатории фармакогеномики ИХБФМ СО РАН Максим Александрович Корюков.

По материалам пресс-службы ИХБФМ СО РАН

Иллюстрация из открытых источников

Больше информации по Академгородку 2.0 и СКИФ — в нашем Телеграм!