В Академгородке создадут программную платформу для прорывных биологических исследований
О разработке такой платформы договорились специалисты ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН» и Института вычислительной математики и математической геофизики СО РАН, подписав соответствующее соглашение.
С момента начала массового секвенирования геномов методы биоинформатики и системной компьютерной биологии прочно вошли в арсенал исследовательских инструментов, используемых во всех областях наук о жизни. Однако в последнее десятилетие их значимость еще более возросла: в связи со стремительным развитием омиксных технологий (геномики, транскриптомики, протеомики, метаболомики) и других высокопроизводительных методов экспериментального исследования молекулярно-генетических систем и процессов в генетике произошел информационный взрыв, и она стала главным источником больших данных, перегнав по темпам роста все другие науки и технологии.
«Огромные объемы и сложность накапливаемых в настоящее время больших генетических данных требуют создания информационно-программных комплексов, основанных на новом поколении методов биоинформатики и системной компьютерной биологии, использующих вычислительные конвейеры, реализующие сложные сценарии анализа и интегрирующие большое количество разнообразных программных продуктов и баз данных, в том числе — с использованием методов искусственного интеллекта», — отметил научный руководитель ИЦиГ СО РАН академик Николай Александрович Колчанов.
Такой подход подразумевает развитие не только собственно биологических методов исследований, но и математического аппарата для работы с ними. Очередным шагом на этом пути стало соглашение о сотрудничестве, заключенное между ИЦиГ СО РАН и ИВМиМГ СО РАН.
Николай Колчанов, Михаил Марченко, директор ФИЦ ИЦиГ СО РАН академик Алексей Кочетов
Прежде всего, речь идет о совместной работе над созданием интегрированной цифровой платформы «Биоинформатика и системная компьютерная биология». «Главная наша задача — совместными усилиями создать программную платформу, объединяющую методы анализа геномной информации и математические методы ее обработки для проведения прорывных исследований в области живых систем», — рассказал директор ИВМиМГ СО РАН, профессор РАН доктор физико-математических наук Михаил Александрович Марченко.
Создаваемый программный комплекс будет ориентирован на поддержку фундаментальных и прикладных исследований в области наук о жизни, в том числе в таких важных направлениях, как биомедицина, фармакология, биотехнологии, сельское хозяйство, экология, биобезопасность.
Кроме того, соглашение подразумевает сотрудничество двух институтов при подготовке специалистов высшей квалификации в области биоинформатики, компьютерной системной биологии, анализа больших данных, анализа изображений, математического моделирования, высокопроизводительных вычислений, а также совместную организацию и координацию научного направления по биоинформатике и компьютерной системной биологии в журнале «Проблемы информатики», издаваемом ИВМиМГ СО РАН.
По материалам пресс-службы ИЦиГ СО РАН
Больше информации о программе «Академгородок 2.0» и СКИФ — на нашем телеграм-канале
Первым посетителем, который протестировал работу новых экспонатов,...
Хатчи — это основа станции, на которую...
Чувствительный элемент сенсора (площадью несколько квадратных миллиметров)...